Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phtf1Q9QZ09 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phtf1Q9QZ09 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms