Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tomm40Q9QYA2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms