Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nphp1Q9QY53 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms