Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmQ9QXG2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms