Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms