Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rabgef1Q9JM13 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rabgef1Q9JM13 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms