Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd1aQ9JLR9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms