Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms