Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Arl6ip1Q9JKW0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Arl6ip1Q9JKW0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms