Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pole3Q9JKP7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pole3Q9JKP7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pole3Q9JKP7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pole3Q9JKP7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms