Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin1Q9JKF6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms