Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms