Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra4Q9JJT2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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