Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms