Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ush1cQ9ES64 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ush1cQ9ES64 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms