Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn2Q9ER65 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn2Q9ER65 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms