Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfrsf23Q9ER63 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tnfrsf23Q9ER63 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms