Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms