Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms