Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnft1Q9DCN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnft1Q9DCN7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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