Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt112Q9DCG9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms