Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Csnk1dQ9DC28 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Csnk1dQ9DC28 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnk1dQ9DC28 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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