Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smg9Q9DB90 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smg9Q9DB90 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms