Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf580Q9DB38 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms