Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms