Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fip1l1Q9D824 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms