Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmigd1Q9D7L8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms