Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl40Q9D783 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms