Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc94Q9D6J3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms