Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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PudpQ9D5U5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PudpQ9D5U5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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