Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tomm20lQ9D4V6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms