Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms