Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stag1Q9D3E6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms