Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms