Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms