Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Chchd2Q9D1L0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms