Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms