Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syf2Q9D198 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Syf2Q9D198 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms