Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Hddc3Q9D114 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms