Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem53Q9D0Z3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms