Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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