Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CWU4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CWU4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms