Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MINDY3Q9CV28 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MINDY3Q9CV28 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms