Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5sQ9CRA7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms