Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms