Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PompQ9CQT5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PompQ9CQT5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms