Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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