Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpa3Q9CQ71 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpa3Q9CQ71 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rpa3Q9CQ71 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rpa3Q9CQ71 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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