Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Use1Q9CQ56 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Use1Q9CQ56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Use1Q9CQ56 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Use1Q9CQ56 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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