Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg3Q9CPX6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms